การตรวจสอบที่ใช้ระบบจะตรวจสอบประสิทธิผลทั่วไปประสิทธิภาพและความประหยัดของกระบวนการระบบการควบคุมและประสิทธิภาพในหน่วยปฏิบัติงานหรือในองค์กรที่สมบูรณ์ สามารถรับรองได้ว่าทุกองค์ประกอบขององค์กรทำงานเพื่อบรรลุเป้าหมาย ผู้ตรวจสอบที่ใช้การตรวจสอบที่เป็นระบบจะต้องได้รับความรู้ที่ครอบคลุมเกี่ยวกับหน่วยงานหรือวัตถุประสงค์ของ บริษัท โครงสร้างองค์กรและลักษณะการดำเนินงาน การศึกษาขั้นต้นอย่างละเอียดและการวิเคราะห์ข้อมูลเสร็จสิ้นก่อนที่การตรวจสอบจะเริ่มขึ้น การตรวจสอบตามระบบมีข้อดีและข้อเสีย
การควบคุมปัญหาอย่างทันท่วงที
การตรวจสอบที่ใช้ระบบประเมินประสิทธิภาพของหน่วยงานที่เกี่ยวข้องกับวัตถุประสงค์การจัดการและการปฏิบัติตามนโยบายและขั้นตอน ความไม่เพียงพอและจุดอ่อนได้รับการแก้ไขเพื่อให้แน่ใจว่าไม่มีการเบี่ยงเบนทางวัตถุจากทิศทางที่กำหนด ข้อเสนอแนะสามารถช่วยปรับปรุงประสิทธิภาพและประสิทธิผลและในที่สุดก็บรรลุเป้าหมายขององค์กรอย่างเต็มที่ ความสำคัญอยู่ที่การปรับปรุงการดำเนินงานที่ไม่มีประสิทธิภาพเสมอ
การใช้ทรัพยากรอย่างเหมาะสมที่สุด
การตรวจสอบประเภทนี้ต้องการความเข้าใจในกิจกรรมที่เกี่ยวข้องของลูกค้ารวมถึงการควบคุมภายในที่เกี่ยวข้องกับกิจกรรม ความเข้าใจดังกล่าวมีความสำคัญเนื่องจากหน่วยงานต่างๆแตกต่างกัน พื้นที่ที่มีความเสี่ยงสูงจะถูกระบุและให้ความสำคัญในระหว่างการตรวจสอบด้วยระบบ สิ่งนี้ทำให้มั่นใจได้ว่าส่วนใหญ่ของทรัพยากรการตรวจสอบที่ จำกัด มีส่วนเกี่ยวข้องกับปัญหา
ความยากลำบากในการได้รับหลักฐาน
ข้อเสียของการตรวจสอบโดยใช้ระบบคือต้องการหลักฐานที่ครอบคลุมเพื่อสนับสนุนการวัดประสิทธิภาพประสิทธิผลและประสิทธิภาพที่ต้องการ การทดสอบที่ใช้กันทั่วไป ได้แก่ เอกสารการสังเกตและการวิเคราะห์ หากการตรวจสอบตรวจสอบกิจกรรมที่ซับซ้อนการรับและตีความพยานหลักฐานนั้นเป็นเรื่องยากหรือต้องใช้ความเชี่ยวชาญทางเทคนิคสำหรับสาขาเฉพาะและความเชี่ยวชาญด้านเทคนิคอาจไม่สามารถใช้ได้
ขาดการประเมินมาตรฐาน
ต้องมีการพัฒนาเกณฑ์การประเมินสำหรับแต่ละสถานการณ์โดยปกติแล้วจะหารือกับบุคลากรของลูกค้าซึ่งทำให้การตรวจสอบแต่ละครั้งมีส่วนร่วมอย่างเท่าเทียมกัน ผู้สอบบัญชีต้องศึกษาแนวโน้มในอดีตตรวจสอบมาตรฐานของกลุ่มเพื่อนหรือใช้มาตรฐานที่แน่นอนและต่อรองเพื่อกำหนดเกณฑ์ที่เหมาะสม นอกจากนี้ยังไม่มีมาตรฐานการรายงานสำหรับการตรวจสอบระบบเนื่องจากแต่ละการตรวจสอบมีข้อกำหนดและผลลัพธ์เฉพาะ